O DJI Mini 3 Pro utiliza a Bateria de Voo Inteligente (2.453 mAh, até 34 min) ou a Bateria Plus (3.850 mAh, até 47 min), ambas Li-ion de 7,38 V. As baterias oficiais (modelo BWX162) garantem gerenciamento inteligente, enquanto a versão Plus pesa aproximadamente 121g e oferece maior autonomia para voos longos.